IA para predecir posibles nuevos virus

88

La covid lo ha puesto todo patas arriba. Se trata de una enfermedad infecciosa, como muchas otras emergentes en seres humanos. Son zoonóticas, es decir, causadas por virus procedentes de otras especies animales. Por eso, identificar antes los virus de alto riesgo es todo un reto, porque puede mejorar las prioridades de investigación y vigilancia.

El aprendizaje automático, un tipo de inteligencia artificial (IA), a partir de los genomas de los virus puede predecir la probabilidad de que cualquiera de ellos que infecte a los animales pase a los humanos, dada una exposición biológicamente relevante, según un estudio publicado en la revista PLOS Biology.

Para desarrollar modelos de aprendizaje automático a partir de secuencias de genomas virales, los investigadores Nardus Mollentze, Simon Babayan y Daniel Streicker, de la Universidad de Glasgow (Reino Unido), recopilaron primero un conjunto de datos de 861 especies de virus de 36 familias. Luego, construyeron modelos de aprendizaje automático, que asignaron una probabilidad de infección humana basada en la taxonomía del virus y/o su parentesco con los virus conocidos que infectan a los humanos.

El siguiente paso, según recoge Europa Press, fue aplicar el modelo de mejor rendimiento para analizar patrones en el potencial zoonótico previsto de otros genomas de virus muestreados de una serie de especies.

Así, los investigadores descubrieron que los genomas virales pueden tener características generalizables que son independientes de las relaciones taxonómicas del virus y pueden preadaptar los virus para infectar a los humanos.

Gracias a este descubrimiento, pudieron desarrollar modelos de aprendizaje automático capaces de identificar las zoonosis candidatas a partir de los genomas virales.

Sin embargo, estos científicos señalan que estos modelos tienen limitaciones, ya que los modelos informáticos son sólo un paso preliminar para identificar los virus zoonóticos con potencial para infectar a los humanos. Los virus señalados por los modelos requerirán, además, pruebas de laboratorio confirmatorias antes de realizar importantes inversiones de investigación adicionales.

En este sentido, aunque estos modelos predicen si los virus pueden infectar a los humanos, la capacidad de infección es sólo una parte del riesgo zoonótico más amplio, en el que también influye la virulencia del virus en los humanos, la capacidad de transmisión entre humanos y las condiciones ecológicas en el momento de la exposición humana.

“Nuestros resultados demuestran que el potencial zoonótico de los virus puede deducirse en una medida sorprendente a partir de su secuencia genómica. Al destacar los virus con mayor potencial zoonótico, la clasificación basada en el genoma permite orientar con mayor eficacia la caracterización ecológica y virológica”, subrayan los investigadores.

Además, los autores valoran el papel de la IA en la prevención de enfermedades y en la salvaguarda de la salud pública: “Estos hallazgos añaden una pieza crucial a la ya sorprendente cantidad de información que podemos extraer de la secuencia genética de los virus mediante técnicas de IA”.

SPORT (29/09/2021)

Más información aquí

Si te resultó útil...Share on Facebook
Facebook
Tweet about this on Twitter
Twitter
Share on LinkedIn
Linkedin
Email this to someone
email